Polymérase
La photocopieuse. Le taux d'erreur définit la vitesse à laquelle un nuage de mutants apparaît.
La biologie ici est une génétique des populations avec un temps de génération très court. Des milliards d’exemplaires rendent visibles des événements rares.
La dérive s’accumule dans les gènes de surface sous la pression des anticorps. Le changement est un mécanisme différent et une échelle de temps historique différente.
Parties
Segments de génome ou un seul morceau
La grippe est segmentée ; de nombreux autres virus à ARN ne le sont pas. L'architecture change ce que le « mélange » peut signifier.
Antigènes de surface
HA/NA ou Spike sont ce que les anticorps voient souvent en premier ; leur changement entraîne beaucoup de langage saisonnier.
Cloud intra-hôte
Une seule infection est déjà un mélange. Le séquençage d’un écouvillon rapporte un consensus ainsi que des variantes minoritaires.
Goulot
Peu de particules démarrent l’hôte suivant, tant de diversité est perdue à chaque transmission.
Paysage immunitaire
L’infection antérieure et la vaccination déterminent quels mutants peuvent se développer dans une population cet hiver.
Cycle de vie
1Rafale de réplication
Les cellules fabriquent un grand nombre de génomes ; les erreurs apparaissent comme une question de statistiques.
2Essaim mixte
Des mutants apparentés coexistent ; la plupart ne font jamais la une des journaux.
3Filtre des hôtes
La transmission et l’immunité amplifient certains génomes et en éteignent d’autres.
4Lignée nommée
Si un cluster se propage largement, les laboratoires et l’OMS peuvent le déposer pour des vaccins et des discussions sur les risques.
Les étapes d’ingénierie sont hors de portée. Le tableau utile est la sélection selon la diversité existante dans la nature et les cliniques.
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